Zeitschrift für Infektionskrankheiten und Präventivmedizin
Offener Zugang

Abstrakt

Gesamtgenomsequenzierung zum Nachweis zoonotischer Tuberkulose in Queretaro, Mexiko

Claudia Angelica Perea Razo, Feliciano Milian Suazo, Isabel Barcenas Reyes, Susana Sosa Gallegos, Elba Rodriguez Hernandez, Susana Flores Villalva und Germinal Jorge Canto Alarcon

Insgesamt wurden 2.736 Proben, Auswurf, Urin und andere Körperflüssigkeiten, die von 1.154 Tuberkulose-verdächtigen Patienten in Queretaro, Mexiko, gesammelt wurden, in die Studie einbezogen. Alle Proben wurden säurefest gefärbt und in selektiven Medien (Stonebrink und Lowenstein-Jensen) kultiviert. Die Genotypisierung der Isolate erfolgte mittels Spoligotypisierung und Einzelnukleotid-Polymorphismus (SNP)-Gesamtgenomsequenzierung. Die erhaltenen Spoligotypen und SNP-Typen von Mycobacterium bovis wurden mit denen von Rindern verglichen, die in einer Datenbank gefunden wurden. 21 (1,8 %) Isolate von Mycobacterium wurden durch Kultur gewonnen, alle aus Auswurf; zwei (13 %) wurden mittels Spoligotypisierung als M. bovis identifiziert , SB0673 und SB0971, die häufig bei Rindern in Mexiko gefunden werden. Bei 15 der Isolate wurde eine vollständige Genomsequenzierung durchgeführt, wobei zwei als M. bovis bestätigt wurden . Die SNP-Muster der beiden M. bovis -Isolate vom Menschen ähnelten denen, die bei Rindern in verschiedenen Teilen Mexikos gefunden wurden.