Zeitschrift für Gartenbau
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Abstrakt

De novo Transkriptomsequenzierung von kältebehandeltem Kentucky-Bluegras (Poa pratensis) und Analyse der an der Kältetoleranz beteiligten Gene

Zhang L, Ren J, Li T, Wang A und Tan D

Kentucky-Bluegras ( Poa pratensis ) ist sehr resistent gegen Kältestress. Obwohl der molekulare Mechanismus der Pflanzenreaktion auf Kältestress in Modellpflanzen ausführlich dokumentiert wurde, weiß man über die Kältetoleranz von Kentucky-Bluegras auf genomischer Ebene wenig. Hier haben wir die Transkriptome von Kentucky-Bluegrass bei Kältebehandlung (-5 °C) und bei Kontrollbehandlung (20 °C) mittels RNA-Sequenzierung und De-novo-Assemblierung verglichen. Insgesamt wurden 75.934 Unigene generiert, von denen 53.762 erfolgreich in öffentlichen Datenbanken annotiert wurden. Beim Vergleich der Transkriptome der Kontroll- und der kältebehandelten Pflanzen wurden 3.896 Unigene als unterschiedlich exprimiert identifiziert. Von diesen Genen waren bei den kältebehandelten Pflanzen 2.410 herunter- und 1.486 hochreguliert. Einige zuvor gemeldete kälteinduzierte Proteine, antioxidative Enzyme und Osmoregulationsproteine ​​wurden identifiziert und ihre Expressionsniveaus geschätzt. Darüber hinaus wurden zehn differentiell exprimierte Gene für die qRT-PCR-Verifizierung ausgewählt. Ihre Expressionsmuster stimmten mit den Ergebnissen der RNA-Sequenz überein. Zusätzlich wurden die Transkriptionsfaktorfamilien, d. h. Ethylen-Reaktionsfaktoren, Hitzestress-Transkriptionsfaktoren, NAC-Proteine, WRKY-Domänen-haltige Proteine ​​und Auxin-Reaktionsfaktoren, als differentiell exprimierte Gene identifiziert. Die Identifizierung dieser beteiligten Gene wird Studien zur transkriptionellen Regulierung der Kältetoleranz bei Pflanzen erleichtern.