Zeitschrift für medizinische Diagnosemethoden
Offener Zugang

Abstrakt

Die Entwicklung und Innovation von zellfreien DNA-Tests von Spendern bei Transplantationen

Wong L, Scott S, Grskovic M, Dholakia S, Woodward RN

Hintergrund: Im AlloSure-Test wurden Verbesserungen an der Messung von zellfreier DNA von Spendern vorgenommen, um schnellere Durchlaufzeiten, einen optimierten Laborablauf und eine niedrigere Nachweisgrenze zu erreichen. Die Leistungsmerkmale wurden durch analytische Validierung festgelegt. Klinische Proben wurden verwendet, um die Gleichwertigkeit mit dem ursprünglichen Test nachzuweisen. Materialien und Methoden: AlloSure 3.0 wurde mit einer einzigen Multiplex-Bibliotheksvorbereitung und einer einzigen Read-Sequenzierung implementiert, um den Arbeitsablauf zu optimieren und die Verarbeitungszeit zu verkürzen. Die analytische Leistung des Tests wurde gemäß CLSI-Methoden charakterisiert. Ergebnisse: Die Leistung von AlloSure 3.0 ist im Vergleich zur Leistung des ursprünglichen AlloSure-Tests verbessert. Der berichtbare Bereich reicht von 0,12 % bis 16 % zellfreier DNA von Spendern (dd-cfDNA). Die Präzision hat sich ebenfalls verbessert, mit einem Variationskoeffizienten von Lauf zu Lauf von 2,7 %. Nach diesen Verbesserungen des Tests haben wir eine 99-prozentige Übereinstimmung mit der ursprünglichen Version von AlloSure für klinische Proben festgestellt. Schlussfolgerung: Laufende Verbesserungen der Methoden für zellfreie DNA von Spendern führten zu einem größeren berichtbaren Bereich, verkürzten Durchlaufzeiten und verbesserter Präzision, während die gleiche Genauigkeit wie bei der Erstveröffentlichung von AlloSure beibehalten wurde. Die verbesserte Leistung ermöglicht einen größeren Bereich für die Bewertung dynamischer Änderungen, die nachweislich über eine durch T-Zellen vermittelte Abstoßung geringen Grades informieren.