Arzneimitteldesign: Offener Zugang
Offener Zugang

Abstrakt

Identifizierung der Bindungsaffinität von TAP-Peptiden zur Entwicklung eines fragmentbasierten Impfstoffes aus dem langen Neurotoxin 2 [ N. naja ]

Sherkhane AS und Gomase VS

Das Protein Long Neurotoxin 2 aus dem Gift der Naja naja weist eine hohe Affinität zu Acetylcholinrezeptoren auf, die durch Blockierung der neuromuskulären Übertragung an der postsynaptischen Stelle periphere Lähmungen hervorrufen. In dieser Studie verwenden wir eine auf kaskadiertem SVM basierende TAPPred-Methode, die 26 TAP-Transporterpeptidregionen mit hoher Affinität gefunden hat. TAP ist ein heterodimeres Transmembranprotein, das Antigen-Peptidproteine ​​​​zum endoplasmatischen Retikulum transportiert, wo es an MHC-Klasse-I-Moleküle gebunden ist. Diese MHC-Peptidkomplexe werden auf der Oberfläche antigenpräsentierender Zellen (APCs) gespeichert, wo sie von T-Zellrezeptoren erkannt werden und eine Immunreaktion auslösen. Daher ist die Vorhersage von TAP-bindenden Peptiden hilfreich bei der Identifizierung der MHC-Klasse-I-restringierten T-Zell-Epitope und damit bei der Entwicklung synthetischer Peptidimpfstoffe.