Angewandte Mikrobiologie: Offener Zugang
Offener Zugang

ISSN: 2471-9315

Abstrakt

Mikrobielle Diversität Ammoniak oxidierender Bakterien durch Abwassergenomik

Maulin Pramod Shah and Reddy GV

Autotrophe Ammoniak oxidierende Bakterien sind ein entscheidender Faktor der mikrobiellen Gemeinschaft in industriellen Abwasserbehandlungssystemen. Wir haben die Diversität und Gemeinschaftszusammensetzung von β-proteobakteriellen Ammoniak oxidierenden Bakterien in zwei Behandlungsreaktoren in Originalgröße - einem Sandfilter und einem biologischen belüfteten Filter - untersucht, die ein identisches Abwasser erhalten. Die Polymerase-Kettenreaktion der 16S rRNA-Genfragmente von Ammoniak oxidierenden Bakterien-selektiven Primern wurde mit denaturierender Gradientengelelektrophorese kombiniert, um eine vergleichende Analyse der dominanten Ammoniak oxidierenden Bakterienpopulationen zu ermöglichen. Die phylogenetischen Affinitäten der dominanten Ammoniak oxidierenden Bakterien wurden durch Klonen und Sequenzieren von durch Polymerase-Kettenreaktion amplifizierten 16S rRNA-Genfragmenten verifiziert. Denaturierende Gradientengelelektrophoreseprofile wurden anhand eines wahrscheinlichkeitsbasierten Ähnlichkeitsindex ausgewertet. Die Nutzung eines probabilistischen Ähnlichkeitsindex ermöglichte es uns, die Unterschiede und Ähnlichkeiten, die in der Struktur der Gemeinschaft ammoniakoxidierender Bakterien in verschiedenen Proben beobachtet wurden, als statistisch signifikant zu betrachten oder auf zufällige Übereinstimmungen von Bändern in den Profilen der denaturierenden Gradientengelelektrophorese zurückzuführen, die auf eine zufällige Besiedlung der Reaktoren mit verschiedenen ammoniakoxidierenden Bakterien schließen lassen. Alle möglicherweise ähnlichen Sequenzen wurden erkannt und der Gattung Nitrosomonas zugeordnet. In den Tropfkörpern wurde eine größere Vielfalt ammoniakoxidierender Bakterien festgestellt als im BAF. Bei allen analysierten Proben wurde eine Dominanz von ammoniakoxidierenden Bakterien festgestellt, die am engsten mit Nitrosococcus mobilis verwandt sind. Eine numerische Untersuchung der Profile der denaturierenden Gradientengelelektrophorese ergab, dass die Gemeinschaft ammoniakoxidierender Bakterien in den Tiefenprofilen der Filterbetten nicht zufällig ausgewählt wurde.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
Top