Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik

Zeitschrift für Proteomik und Bioinformatik
Offener Zugang

ISSN: 0974-276X

Abstrakt

Überexpression von Kinesin-assoziiertem Protein 3 (KIFAP3) bei Brustkrebs

Deepthi Telikicherla, Jagadeesha Maharudraiah, Harsh Pawar, Arivusudar Marimuthu, Manoj Kumar Kashyap, YL Ramachandra, Juan Carlos Roa und Akhilesh Pandey

Studien zur Genexpressionsprofilierung bei Brustkrebs haben Kataloge unterschiedlich exprimierter Gene erstellt. Viele dieser Gene wurden jedoch nicht auf ihre Expression auf Proteinebene untersucht. Mithilfe von Brustkrebsgewebe-Mikroarrays ist es möglich, solche Gene systematisch und mit hohem Durchsatz auf ihre Überexpression auf Proteinebene zu untersuchen. Unsere Strategie umfasste die Integration von Informationen aus öffentlich verfügbaren Genexpressionsrepositorien, um eine Liste der auf mRNA-Ebene bei Brustkrebs hochregulierten Gene zu erstellen, gefolgt von einer Kuratierung der veröffentlichten Literatur, um diejenigen Gene zu identifizieren, die nicht auf Überexpression auf Proteinebene getestet wurden. Wir haben Kinesin Associated Protein 3 (KIFAP3) als ein solches Molekül für eine weitere Validierung auf Proteinebene identifiziert. Die immunhistochemische Markierung von KIFAP3 mithilfe von Brustkrebsgewebe-Mikroarrays ergab eine Überexpression des KIFAP3-Proteins bei 84 % (240/285) der Brustkrebserkrankungen, was den Nutzen unseres integrierten Ansatzes der Kombination von Computeranalyse und experimenteller Biologie zeigt.

Haftungsausschluss: Diese Zusammenfassung wurde mithilfe von Tools der künstlichen Intelligenz übersetzt und wurde noch nicht überprüft oder verifiziert.
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