Zeitschrift für klinische Studien
Offener Zugang

Abstrakt

Bioinformatische Analyse: Die Rolle von LINC00634 beim kolorektalen Karzinom

Fang Liu, Fengyihuan Fu*, Yuqiang Nie

Hintergrund: LINC00634 wird bei Speiseröhrenkrebs stark exprimiert, und sein Mangel kann die Lebensfähigkeit von Speiseröhrenkrebszellen unterdrücken und deren Apoptose auslösen. Es fehlen jedoch Studien, die den Zusammenhang zwischen der Expression von LINC00634 und den klinisch-pathologischen Merkmalen, Überlebensergebnissen, Prognosefaktoren und der Tumorimmunzellinfiltration von Patienten mit kolorektalem Karzinom (CRC) untersuchen.

Ziel: Unser Ziel ist es, die Rolle von LINC00634 beim kolorektalen Karzinom zu untersuchen.

Methoden: Wir haben Daten aus der öffentlichen TCGA-Datenbank (The Cancer Genome Atlas), der GTEx-Datenbank (Genotype-Tissue Expression) und klinischen Proben bezogen. Wilcoxon-Rangsummentest, Kruskal-Wallis-Test und logistische Regressionsanalyse wurden eingesetzt, um die Beziehung zwischen dem LINC00634-Ausdruck und den klinisch-pathologischen Merkmalen von CRC-Patienten zu bewerten. Die Receiver-Operating-Characteristic-Kurve (ROC) wurde erstellt, um die Fähigkeit von LINC00634 zur Unterscheidung zwischen CRC-Patienten und normalen Probanden anhand des AUC-Werts (Area Under the Curve) zu bewerten. Univariate und multivariate Analysen wurden durchgeführt, um den Zusammenhang zwischen Prognosefaktoren und Überlebensergebnissen zu bewerten. Kaplan-Meier-Kurven und Cox-Regressionsanalysen wurden eingesetzt, um den Beitrag des LINC00634-Ausdrucks zur Prognose von Patienten mit kolorektalem Karzinom zu bestimmen. Immuninfiltrationsanalyse und Gen-Set-Anreicherungsanalyse (GSEA) wurden durchgeführt, um die signifikant beteiligten Funktionen von LINC00634 zu identifizieren. Abschließend wurde zur internen Verifizierung ein Nomogramm auf Basis der Cox-Regressionsdaten erstellt.

Ergebnisse: Die Expression von LINC00634 war bei CRC-Patienten hochreguliert und deutlich mit N-Stadium, Resttumor, pathologischem Stadium und Gesamtüberleben (OS) assoziiert. Die ROC-Kurve zeigte, dass LINC00634 starke diagnostische und prognostische Fähigkeiten hatte (AUC = 0,74). Die hohe Expression von LINC00634 konnte ein schlechtes krankheitsspezifisches Überleben (DSS; P = 0,008) und ein schlechtes Overroll-Überleben (OS; P < 0,01) vorhersagen. Die Expression von LINC00634 war unabhängig mit OS bei CRC-Patienten assoziiert (P = 0,019). GSEA und Immuninfiltrationsanalyse zeigten, dass die Expression von LINC00634 an der Gentranskription, der epigenetischen Regulierung und den Funktionen bestimmter Arten immuninfiltrierender Zellen beteiligt war. Der C-Index des Nomogramms betrug 0,772 (95 % KI: 0,744–0,799).

Schlussfolgerung: Unsere Studie zeigt, dass LINC00634 als potenzieller prognostischer Biomarker für CRC-Patienten dienen kann.