Die molekulare Pathologie ist ein Zweig der Pathologie, der sich mit der Untersuchung von Molekülen in Geweben, Organen oder biologischen Flüssigkeiten befasst, die bei der Diagnose von Krankheiten hilfreich sind. Es konzentriert sich auf submolekulare Aspekte von Krankheiten. Antikörperbasierte Immunfluoreszenz-Gewebetests, DNA-Sequenzierung und quantitative PCR sind die Techniken, die in der molekularen Pathologie eingesetzt werden.